Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSME1Q06323 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSME1Q06323 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms