Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSPL2Q05D32 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms