Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7AQ04656 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms