Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPCQ03188 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms