Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREMQ03060 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREMQ03060 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CREMQ03060 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CREMQ03060 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREMQ03060 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREMQ03060 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREMQ03060 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms