Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms