Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCQ00610 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms