Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC5Q00444 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms