Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVS71-1P61550 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms