Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABP4P57796 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABP4P57796 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CABP4P57796 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms