Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP1P56182 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP1P56182 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP1P56182 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP1P56182 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1P56182 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1P56182 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1P56182 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP1P56182 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms