Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF1P55201 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRPF1P55201 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms