Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D1P54289 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms