Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms