Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DAP3P51398 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms