Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATMP50440 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATMP50440 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATMP50440 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATMP50440 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATMP50440 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATMP50440 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATMP50440 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATMP50440 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATMP50440 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATMP50440 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATMP50440 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATMP50440 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATMP50440 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATMP50440 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATMP50440 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms