Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRIM1P49642 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIM1P49642 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms