Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIA4P48058 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms