Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPB2P35606 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPB2P35606 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPB2P35606 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB2P35606 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB2P35606 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms