Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP6P35125 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP6P35125 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP6P35125 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP6P35125 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP6P35125 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP6P35125 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP6P35125 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP6P35125 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms