Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms