Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD34P28906 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD34P28906 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD34P28906 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms