Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRNP28799 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRNP28799 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRNP28799 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRNP28799 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRNP28799 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms