Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXP28300 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXP28300 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXP28300 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXP28300 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms