Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB5P28074 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms