Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRBP23467 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
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