Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SPRR1BP22528 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms