Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms