Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCP20941 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCP20941 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCP20941 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCP20941 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCP20941 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCP20941 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCP20941 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCP20941 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCP20941 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms