Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms