Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNB1P20700 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms