Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF4P18848 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms