Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPI1P17947 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPI1P17947 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms