Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD46P15529 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD46P15529 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD46P15529 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD46P15529 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD46P15529 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD46P15529 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD46P15529 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD46P15529 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms