Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P0C879 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P0C879 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P0C879 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms