Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMBP08118 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMBP08118 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MSMBP08118 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MSMBP08118 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSMBP08118 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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