Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3DP05423 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms