Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGAP02671 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGAP02671 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGAP02671 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGAP02671 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms