Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA17P01571 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms