Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBX7O95931 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms