Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C6orf47O95873 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms