Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms