Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN7O95471 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms