Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP19O94966 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP19O94966 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP19O94966 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP19O94966 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP19O94966 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP19O94966 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP19O94966 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms