Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms