Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLOT1O75955 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLOT1O75955 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms