Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBOX1O75936 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms