Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPFIA4O75335 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms