Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP3O75154 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP3O75154 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms