Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG13O75143 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG13O75143 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG13O75143 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms